난자 채취시기가 너무 빠르면 난자가 미숙하고, 너무 늦으면 배란이 되어 버리거나 난자가 과숙하여 성공률이 낮아집니다. 그러므로 과배란유도 과정 중에 몇차례의 초음파 검사를 통해 난포의 성장을 면밀히 모니터하고 난자채취 시기를 결정하는 것이 매우 중요합니다. 난자채취 시점이 결정되면 최종적으로 난자 성숙과 배란을 유도하는 호르몬 주사를 맞게 되고, 약 36시간 후 난자 채취를 시행합니다. 정맥주사를 통해 진정제 투여 후, 질 초음파로 난소를 보면서 질을 통해 바늘로 난자를 채취합니다.
소요시간은 20-30분 정도이며, 마취에서 깨어난 후 환자의 상태가 안정되면 귀가할 수 있습니다. 이 난자는 배란 전 난소에서 채취되었기 때문에 수정하기 전 성숙과정이 필요한데 이식 대상자의 몸 속 환경과 비슷한 배양액에서 일정시간 배양되면서 성숙됩니다.